非盟非洲大陆自贸区首席技术顾问保德·塞巴希兹（Prudence Sebahizi）在7月底曾表示，原定于5月在约翰内斯堡举行的峰会本将澄清一些关于AfCFTA悬而未决的问题。而受疫情影响，峰会已推迟至12月，非洲大陆自贸区的启动也已推迟至2021年初。塞巴希兹称，非洲各国已经意识到，他们比以往任何时候都更需要非洲大陆自贸协定。疫情导致各国关闭边境，许多没有海上港口的国家实际已与国际贸易隔绝，这种情况反而将激发“更多合作精神”。
    尼日利亚GIGA研究所的政治学家Lynda Iroulo则认为，疫情为非洲区域一体化提供了机会。她表示，此前，非洲一直严重依赖从欧洲、中国、美国等世界其他地区进口产品，而疫情导致全球供应链中断，市场失灵，特别是在医疗卫生防护设备领域，非洲各国不得不寻求自救。而这也正是非洲大陆自贸区发挥作用的地方，自贸区将帮助全非减少贸易壁垒，并受益于各类应运而生的创新自救措施。这也是区域一体化的意义所在，即利用非洲资源造福非洲人民。疫情促使非洲大陆自贸区的尽快启动，也使非洲各国的合作向前大步迈进。
    疫情有望推动非洲大陆自贸区尽快启动的另一个原因是它为非洲各国关于自贸协定的谈判提示了一些被遗忘或忽视的内容。塞巴希兹提出，公共卫生和电子商务领域是目前谈判中被忽略的部分，他确信这些领域将在未来的谈判中成为重要议题。南非非营利组织贸易法律中心TRALAC常务董事Trudi Hartzenberg表示，疫情证明了数字解决方案的可行性和电子支付的竞争力。但非洲发展数字经济也存在较大阻碍，如目前尚没有针对非正式跨境贸易的简化规则等。
    尽管如此，受限于腐败和落后的基础设施等，非洲大陆自贸区仍面临巨大挑战。为使其充分发挥作用，非洲各国必须就运输为核心的各领域达成共同标准和统一规则。根据世界银行的最新报告，如果非洲大陆自贸区得到充分实施，它将有可能使3000万人摆脱贫困。到2035年，非洲大陆的收入能够增长4500亿美元。报告称非洲国家应大力推动自贸区的启动，通过贸易建立起足够抵御未来冲击的能力，也是帮助非洲大陆从疫情中得以恢复的关键因素。